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====== Path analysis ======
A idéia é fazer um "path analysis" usando as matrizes de distância geradas pelos dados de estrutura espacial, edáfica, filogenética, funcional e biótica (biomassa) das comunidades. A análise permitirá testar as relações causais entre essas variáveis (ver esquema). A segunda parte da análise consiste em descobrir quais atributos funcionais das espécies maximizam a correlação entre as variáveis estudadas.

{{análises.rar|}}

===== Dados =====
{{d.txt|D - Estrutura biótica}}{{epa.txt|E - Estrutura edáfica}}{{s.txt|S - Estrutura espacial}}{{x.txt|X - Estrutura funcional}}{{p.txt|P - Estrutura filogenética}}


{{matrizes.rdata|Matrizes}}


===== Funções =====

{{path.analysis_function.r|path.analysis}}
{{maxim_function.r|maxim}}

===== Teste do teste =====
Fiz algumas simulações para testar a robustez e a sensibilidade do teste usando diferentes correlações e número de permutações. Rodei 30 vezes o teste com quatro matrizes de distância para cada valor de correlação simulada.
{{pathanalysis_test.r|}}
==== Resultados ====
{{pathanalysis_test.rdata|}}
{{path_test_graphs.r|}}
{{teste_do_teste.pdf|}}
{{teste_do_teste.jpeg?600|}}

Note que os resultados parecem não diferir entre as correlações nem entre números de permutação. O teste parece robusto, uma vez que em nenhuma vez, quando a correlação simulada era zero, o teste resultou em um p < 0,01 (alfa corrigido por Bonferroni). Por outro lado, há uma janela entre 0 e 0,10 em que pode haver erro do tipo II, acima de 0,10 é muito grande a chance de que o teste detecte a relação entre as variáveis.