====== Vanderlei ======



**SYNCSA**


Fiz algumas modificações nas funções, acho que ficaram bem mais eficientes agora. Agora há a opção de escolher se os atributos estão ou não na mesma escala, o mesmo para as variáveis ambientais. Também há a opção de escolher o método para calcular as distância para o cálculo das correlações de matrizes e o método das correlações. 
Na última atualização foram escritas as funções de maximização de atributos para TCAP, TDAP e TCAP and TDAP.

No arquivo abaixo há todas as funções assim como as instruções para as mesmas. 

{{Syncsa_R_com_Intrucoes.r|}}



**Versões antigas das funções**

Matriz P

{{P.Matrix.r|}}


Matriz T

{{T.Matrix.r|}}


Matriz X

{{X.Matrix.r|}}


Permutação de matrizes

{{permut.matriz.r|}}


Centralização e normalização de matrizes

{{cent.norm.r|}}


Correlação de matrizes

{{cor.matrix.r|}}


SYNCSA

{{syncsa.r|}}


Maximização de correlação entre matrizes

{{maxim.r|}}



**Script para os Testes**

Se alguém tiver interesse de testar as funções abaixo esta o script com os comandos para entradas de dados, calculo das matrizes, das distâncias e correlações. Além disso deixei o Prinda (A saída de dados do Syncsa) quando calculados com os exemplos que estão nesta página. É preciso de todas as funções desta página para dar certo, além de carregado o pacote vegan.

{{testes.r|}}

{{teste_syncsa.txt|}}

Entrada de dados

{{community_data.txt|}}

{{traits_data.txt|}}

{{phylogenetic_distance.txt|}}

{{ambiente_data.txt|}}

Saída de dados

{{matrix.w.txt|}}

{{matrix.q.txt|}}

{{matrix.p.txt|}}

{{matrix.b.txt|}}

{{matrix.t.txt|}}

{{matrix.u.txt|}}

{{matrix.x.txt|}}