==== Reunião de 11 de novembro de 2009 ====

=== Decisões tomadas ===

1. será feito um último campo para coletar estas plantas não morfotipadas. O Marcel e o Gabriel serão sondados sobre essa tarefa. Falta coletar 72 plantas.

2. O Ale rodou uma Análise de Correspondência  (CA) e uma DCA com os dados de densidade, a partir do tutorial do pacote vegan (script abaixo). Essas análises serão refeitas para os dados binários e para a área basal.

{{script_ca.r|}}

=== Assuntos abordados na reunião ===

1. decisão sobre as morfoespécies faltantes: se usaremos a área basal como variável, as faltas não estão distribuídas de forma homogênea entre os fragmentos.\\

2. como fazer a análise PCO (PCoA): fiz parte de um exemplo usando os pacotes, mas não estão claras as coisas mais básicas, como por exemplo a estrutura dos dados para o início da análise. Além disso, não entendi o que representa o resultado que obtive. \\ 
Decisões:\\
  * não sei se entendi bem o que vamos ordenar: as parcelas com um código de cada frag? Utilizaremos a área basal ou a densidade?
  * como organizar a planilha para a ordenação: espécies são as colunas e cada registro é uma linha. As colunas com o nome dos fragmentos e o número das parcelas são lidas como uma variável equivalente à espécie...
  * qual a medida de similaridade adotar? Li que se eu usar a Distância Euclidiana, o PCO fica equivalente a um PCA, logo pensei na Bray-Curtis, que é a padrão da função 'vegdist' do pacote 'vegan', mas não encontrei uma justificativa para usá-la. \\