====== Mestrado Gabriel ======

[[projeto|Projeto]]

[[barcoding|Barcoding]]

[[reunioes|Reuniões]]

[[analises|Análises]]

[[bibliografia|Referências bibliográficas]]

[[boneco|Boneco da Dissertação]]


**Dissertação: versão antes da banca:**
 
{{gabriel_frey_-_dissertação.pdf|}}

{{gabriel_frey_-_dissertação.docx|}}
==== ARQUIVOS  ====
----

{{projeto_mestrado_gabriel_1.doc|Gabriel, em 10 out 2009 - Projeto}}


{{projeto_mestrado_gabriel_1_cris_12out09.doc|Comentários da Cris (12_out_09)}}


{{projeto12.doc|}}

{{projeto_mestrado_gabriel_1_cris_14out09.doc|}}

{{projeto13.doc|}}


**{{projeto_final_gabriel_2009.doc|Projeto Final}}**


{{legendre_legendre.pdf|}}





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==== DOCS FUSP  ====
{{fusp_plano_pesquisa_bolsista.doc|Plano de Pesquisa}}


==== OLD... ====
  

O arquivo newick tinha um terminal a mais. Isso está acontecendo sempre. Retirei o últim "( )" junto com o nome do último nó e ele funcionou.

Segue o arquivo, camandos do R para fazer a figura e a figura.

  -{{listagabr.txt|}}

<code> 

library(ape) 
## precisa antes baixar o pacote APE no menu > Pacote > Instalar Pacote

peic.gab = read.tree("listaGabr.txt") 
## antes de ler deve retirar o último ramo e os respectivos "()". O arquivo deve estar no mesmo diretório do R, caso contrário não achara o arquivo. Pode mudar o diretório do R pelo menu > Arquivo > Mudar dir... ou pode colocar o endereço completo no read.tree("endereço completo")

plot(peic.gab, cex=0.6)


</code>
{{peic_gab.jpg?500|}}


===== Projeto =====


> Pergunta: Espécies mais relaciondas filogeneticamente tem demografia  mais similar?
>
ACHO QUE A PERGUNTA ESTÁ BOA!

>        Hipótese: Espécies mais proximamente relacionadas  apresentarão taxas de
> crescimento estocástico        populacional mais parecidas  (demografia é uma característica mantida filogenéticamente)

AQUI EU NÃO ENTENDI DIREITO O QUE QUER DIZER COM CRESCIMENTO ESTOCÁSTICO! O MODELO A PRINCIPIO NÃO É ESTOCÁSTICO... PODEMOS ATÉ INCLUIR ALGUMA ESTOCASTICIDADE (AMBIENTAL OU DERIVA).

H:"ESPÉCIES FILOGENETICAMENTE PRÓXIMAS SÃO MAIS EQUIVALENTE DEMOGRAFICAMENTE"

QUANTO AS PREVISÕES:
1 E 2 ESTÃO OK! E TEM COMO PREMISSA QUE OS GENEROS E FAMILIAS REPRESENTAM SÃO MONOFILETICOS.
3: O APGII NAO CHEGA A ESPÉCIE.... SÓ A FAMILIA NO MÁXIMO!

POR ENQUANTO É ISSO!
HÁ UM TRABALHO DO CONDIT QUE FALA SOBRE DEMOGRAFIA MAIS SIMILAR PARA AS ESPÉCIES DE BARRO COLORADO. QUANTO A JUNÇÃO DAS DUAS COISAS, ACHO QUE NÃO VAI ENCONTRAR... ESPERO! ISSO TORNA O TRABALHO MAIS RELEVANTE!
ACHO QUE O LINK TEORICO É A ESTURUTURAÇAO DE COMUNIDADE NO MODELO NEUTRO DE HUBBEL QUE PREVE QUE AS ESPÉCIES (PER CAPITA) SÃO EQUIVALENTES DEMOGRAFICAMENTE... ISSO É VERDADE? HÁ UMA ASSINATURA DISSO FILOGENETICA OU NOS HABIATS?
COLOQUE TUDO NO WIKI!...