====== Manuscrito PEIC 1 - Padrões Gerais ======

===== Reunião 05 março 2007 =====

  - focar  na comparação dos padrões com outras florestas
  - mostar similaridades com "sand soil florests" 
  - fechar com a classificação dessa florestas comum

===== Divisão de Trabalho =====

  * Dri: florística,padrão espacial e conclusão
  * Ale:   refazer a análise por hectare com a nova planilha, ver abstract, climadiagrama e figura da parcela
  * Renatim: tudo!!





===== Introdução =====
O artigo como uma descrição tentando verificar padrões da comunidade de árvores e gerar hipóteses pertinentes sobre o sistema. Além disso vender a idéia de ser a maior área inventariada até o momento para esse tipo de floresta.

===== Mapas de espécies =====

Entre nesse linque para ver os scripts e mapas: [[mapas_man1]] 


===== Número de Fustes =====

Fiz uma análise para ver a diferença de densidade das espécies (12 de maio de 2009):

  *{{teste.fuste.rdata|}} 
  *{{script.testefuste.r|}}






===== Morisita =====


**Ale 06 abril 2009**

Refiz o script para incluir o ajuste do DAP na seleção de diferentes diâmetros de inclusão.

{{script.morisita05abril.r.pdf|script}}
Versão mais atual (05 Abril 2009)


**31 Março 2009**

Depois de reunião no dia de hoje refiz o script Morisita. Achei um único problema, o arquivo antigo não selecionava os fustes 1, o que inflava a agregação. Refiz o script e deixei a função mais geral para as outras parcelas. Inclui no roterio tb. a seleção do estrato >= 10, para podermos fazer com outros estratos. 

{{morisita.rdata.pdf|RData}}

{{script.morisita31marc.r.pdf|script}}
Versão antiga

{{morisita.r.pdf|função morisita}}
Versão mais atual

** 31 janeiro 2009 **

Depois de reunião (Ale e Dri) em 30 janeiro de 2009, refiz as funções e o script do Morisita. 

Além da função básica que retorna o valor observado de morisita, inclui dois modelos de simulações, um de aleatorizações da distribuição de poisson e outro para o modelo de completa aleatoriedade espacial.
O primeiro simula a distribuição nula de poisson a cada simulação, mantendo a mesma média de indivíduos por parcela
O segundo simula o mesmo número de indivíduos distribuidos ao acaso na parcela e em seguida conta o número de indivíduos por parcela e calcula o Morisita. 

{{script.morisita30jan.r.pdf|script}}
Versão antiga (30 jan 2009)

{{morisita.r.pdf|função morisita}}
Versão antiga (30 jan 2009)


**17 Nov 2008**

Dri, fiz a função para rodar a distribuição nula de morisita. Utilizei o modelo nulo com a distribuição Poisson. Ela retorna o valor de p para valores maiores ou iguais ao observado. Pensei em fazer tb para valores menores (distribuição homogenea), mas acho que não vale a pena, ao menos que encontre valores de p muito alto. Segue o script com as funções incluídas nele.

{{scrip.morisita.r.pdf|função morisita}}
Versão antiga (17 Nov 2008)


 





===== Documentos e arquivos =====

{{manuscrito_peic_jan2009.doc|}}

{{manuscrito_peic_17_nov.doc|texto versão 17/Nov/2008}}

{{riqueza_maxima_por_habitat.xls|resultados dos estimadores de riqueza por tipo de solo}}

{{resultados_gerais_peic.xls|resultados gerais}}

{{resultados_por_habitat_peic.xls|resultados por tipo de solo}}

{{isa.xls|Indicator Species Analsis por tipo de solo}}

{{dca.bmp.pdf|scatterplot da DCA}}

 Legenda: Solo 1= Espodossolo F.H. Arênico; Solo 2= Neossolo Quartzarênico; e Solo 3= Espodossolo F.H. Hístico. 

{{peic_fev2009.txt.pdf|}}
Dados atualizados em fevereiro de 2009 por Alexandre para as análises de distribuição espacial e associação de habitats, incluindo códigos lx e ly na coluna //codes// quando o regitro tem problmas de mapeamento. Não influencia as análises aqui feitas.

{{peic_mar_2009.txt|}}
Esses dados de altura são os dados que se encontram nos arquivos da página do PPSP. Os dois arquivos tem alguns dados conflitantes e repetidos. Após tirar esses conflitos fiz uma seleção utilizando a regressão entre dap e altura como critério de decisão.