defini dp e número de ciclos para as próximas simulações (dp = 500 e ciclo = 3e5) a partir de simulações-teste (explicar que as simulações eram interrompidas precocemente)
extremo 1 sp com evolução: hipercubo {xi0 (1 a 5000), dist.pos (1 a 3e5), dist.int (0 a 1) }/ fixos {S (1), j (5000), dp (500), ciclo (3e5), step (100)}
extremo várias spp sem evolução: hipercubo {S (5 a 500), dist.pos (1 a 3e5), dist.int (0 a 1)} / fixos {xi0 (1 a 5000), j (round(5000/S)), dp (0), ciclo (3e5), step (100)}
várias spp com evolução: hipercubo {S (5 a 500), xi0 (1 a 5000), dist.pos (1 a 3e5), dist.int (0 a 1)} / fixos {j(round(5000/S)), dp (500), ciclo (3e5), step (100)}
modifiquei simula_input para fixar o dp em todas as simulações (e não colocar no hipercubo)
modifiquei código de simula.neutra.step para gravar o número de mortes cumulativo
modifiquei o código de simula_ouput para olhar pro tempo de 1 (ou mais) gerações
modifiquei o código de simula_output para acrescentar análises por espécies (média das médias, média das variâncias, etc) e também “taxa de mudança” da estratégia (diferença entre estratégias final e inicial / estratégia inicial)
modifiquei código de simula.neutra.step para retirar o trade-off, rodei algumas simulações e interpretei
modifiquei o código de simula.neutra.step para gerar caracter “neutro” e rodei algumas simulações
modifiquei o código de simula.neutra.step para aceitar indivíduos com valores diferentes de estratégia de vida inicial
entendi problema do servidor (RStudio)
paralelizei o código com os pacotes “plyr” e “doMC”