Reunião 18

Pautas

O que fiz

Coloquei X como argumento e desliguei linha que calculava X como min(xi0)J
Acrescentei vários erros de parada no código, dentre eles um que interrompe a simulação quando há um valor de xi0 maior do que X
Troquei o cálculo inicial da probabilidade de morte de 1/J para xi0/X (na versão com trade-off)
Coloquei argumento para escolha da probabilidade de morte dos indivíduos nas versões da função em que não há o trade-off
Fiz função “GERALZONA” com junção de todas
Trabalhei na minha pergunta: google presentation - minha pergunta
Rodei simulações (bateria 1, bateria 3 OK): problema na bateria 2 (dp 0)
Fiz mini-relatórios: simulações neutras; demônios de Darwin
Rodei simulações com distúrbio
Explorei etapas mais lentas do código (profvis - detalhes no e-mail)
Modifiquei código para retirar geração do banco de sementes (etapa mais lenta) conforme sugestão do Ale
Comecei análise exploratória dos dados

O que vou fazer

Ler documento que Ayana mandou!
Terminar análise exploratória dos dados! (lembrar de plotar gráfico com a distribuição final)
Verificar se 1000 simulações/bateria é um bom valor (SBMA)
Colocar dados mestrado no servidor do Labtrop
Reduzir número de variáveis operacionais
Começar curso Coursera e pensar em expressões matemáticas
Pensar em simulações com distúrbio (sem hipercubo)
- Comparar freq/int de disturbio com aumento da prob de morte
- Comparar freq e int entre si
- Analisar efeito de diferentes distribuições de frequência de distúrbio (talvez aqui haja casos de coexistência)
- Pensar que, ao final, é importante retomar a 'lacuna' q eu citaria na intro (eco vs. evo). Então pensar como explorar isso nos resultados

Pendências e Dúvidas

Corrigir código: banco de semente vs. banco de esperma
Falar que rodei 300 mil ciclos e com dp de 500
Dar detalhes da diferença entre as 3 baterias de simulação e perguntar se há problemas no fato de que na terceira bateria as espécies apresentaram estratégias de vida iniciais espalhadas no gradiente
Eu analiso em vários tempos ou é melhor só em determinado número de gerações?
Mais sugestões de análises exploratórias?