Tabela de conteúdos

 

library(ape) 
## precisa antes baixar o pacote APE no menu > Pacote > Instalar Pacote

peic.gab = read.tree("listaGabr.txt") 
## antes de ler deve retirar o último ramo e os respectivos "()". O arquivo deve estar no mesmo diretório do R, caso contrário não achara o arquivo. Pode mudar o diretório do R pelo menu > Arquivo > Mudar dir... ou pode colocar o endereço completo no read.tree("endereço completo")

plot(peic.gab, cex=0.6)

Projeto

Pergunta: Espécies mais relaciondas filogeneticamente tem demografia mais similar?

ACHO QUE A PERGUNTA ESTÁ BOA!

Hipótese: Espécies mais proximamente relacionadas apresentarão taxas de
crescimento estocástico populacional mais parecidas (demografia é uma característica mantida filogenéticamente)

AQUI EU NÃO ENTENDI DIREITO O QUE QUER DIZER COM CRESCIMENTO ESTOCÁSTICO! O MODELO A PRINCIPIO NÃO É ESTOCÁSTICO… PODEMOS ATÉ INCLUIR ALGUMA ESTOCASTICIDADE (AMBIENTAL OU DERIVA).

H:“ESPÉCIES FILOGENETICAMENTE PRÓXIMAS SÃO MAIS EQUIVALENTE DEMOGRAFICAMENTE”

QUANTO AS PREVISÕES: 1 E 2 ESTÃO OK! E TEM COMO PREMISSA QUE OS GENEROS E FAMILIAS REPRESENTAM SÃO MONOFILETICOS. 3: O APGII NAO CHEGA A ESPÉCIE…. SÓ A FAMILIA NO MÁXIMO!

POR ENQUANTO É ISSO! HÁ UM TRABALHO DO CONDIT QUE FALA SOBRE DEMOGRAFIA MAIS SIMILAR PARA AS ESPÉCIES DE BARRO COLORADO. QUANTO A JUNÇÃO DAS DUAS COISAS, ACHO QUE NÃO VAI ENCONTRAR… ESPERO! ISSO TORNA O TRABALHO MAIS RELEVANTE! ACHO QUE O LINK TEORICO É A ESTURUTURAÇAO DE COMUNIDADE NO MODELO NEUTRO DE HUBBEL QUE PREVE QUE AS ESPÉCIES (PER CAPITA) SÃO EQUIVALENTES DEMOGRAFICAMENTE… ISSO É VERDADE? HÁ UMA ASSINATURA DISSO FILOGENETICA OU NOS HABIATS? COLOQUE TUDO NO WIKI!…