Entrada de Dados no Banco

<hidden Passo 01 - Preparar Arquivo de Localidades> Deve conter as seguintes colunas (sendo cada linha um Quadrante):

LocalidadeReservaLatReservaLongReservaParcelaLatParcelaLongParcelaQuadranteXquadYquad
Gavião1101-2.345-60.45671101-1-2.456-60.345258080


</hidden>

<hidden Passo 02 - Preparar Arquivo Importação de todas as árvores já marcadas> Num primeiro momento deve conter as seguintes colunas (sendo cada linha uma árvore):

ParcelaQuadranteTagnumHabito
1101-1251230Árvore


Num segundo momento importamos o X e Y de cada árvore:

ParcelaQuadranteTagnumXarvYarv
1101-125123014.22.2

</hidden>

<hidden Passo 03 - Arquivos Identificações> Identificações - vários arquivos com histórico das identificações do FITO. <hidden Para preparar arquivos> Quando for indeterminado colocar Indet na coluna correspondente Se o modificador fizer parte do nome incluir na coluna correspondetne, senão colocar cf. aff. na coluna modificadores Colocar AutorEspecie apenas para morfotipos (o resto não precisa) Determinador: quando tiver mais de um separar por ;

ParcelaQuadranteTagnumFamiliaGeneroEspecieInfraspecCategInfraEspeciemodificadoresAutorEspecieDeterminadoresAnoDet
1101-1251230LauraceaeLicariacannellasubsp.canellacf.Andrade, A.; Laurance, S.1995

Preparar uma planilha para cada versão colocando no nome do arquivo a data da versão </hidden> <hidden Arquivos Preparados por Ana Versão 01>

</hidden> <hidden Erros detectados >

</hidden> <hidden Correções Ana>

</hidden> <hidden Registros duplicados> Encontrei registros duplicados nos arquivos preparados Ana Versão 01 no arquivo 01, 05 e 08 usando o script scriptverificaduplicados.r

</hidden> <hidden Arquivos finais Identificação> O script scriptgeraarqimportacao.r gera os arquivos abaixo a partir dos arquivos preparados por Ana versão 01 acima e dups e semdups para 01, 05 e 08!



:!:<fc #FF0000>Como nem todas as plantas mudaram de identificação ao longo dos anos, apenas os registros que mudaram de uma data para outra foram separados para importação no wiki. Os arquivos de cada data que foram importados estão</fc> aqui.:!: </hidden>

</hidden> <hidden Passo 04 - Coleta e data de coleta> Essa planilha deve incluir apenas as árvores que foram coletadas

ParcelaQuadranteTagnumColetadaDataColeta
1101-1251230Sim1995-12-31

</hidden> <hidden Passo 05 - Censos> <hidden Preparar Arquivos> Subir aqui os arquivos de mortalidade e crescimento para cada reserva, em formato xls ou txt (ver abaixo). Irei construir um script para preparar os dados de todos os censos no seguinte formato:

  1. Precisa de data de monitoramento para todas as observações, mas uma mesma coluna de data pode ser compartida por colunas de observações
  2. Qualquer observação ou medição que tenha mais um valor/categoria, separar valor ou categoria por |Parcela|Quadrante|Tagnum|DAP_censo01|Data_censo01|Obs_censo01|Morreu|DataMorreu|Mortalidade01|Mortalidade02|DataMortalidade02|

|1101-1|25|1230|12.3|1995-12-31|cipo solto|morta|2005-08-30|arr raiz; vento|decomp|2010-05-01| </hidden> <hidden Arquivos Importados>

</hidden> </hidden> <hidden Notas sobre os arquivos para importação> Os arquivos devem ser salvos em formato txt, exportado do OpenOffice para garantir compatibilidade de encoding (UTF8) que define os caracteres, e quebras de linha. Isso evita problemas de upload do arquivo ao sistema. Se preparou no excel, abrir o xls no OpenOffice (ou LibreOffice) e salvar como csv, escolhendo as mesmas opções da figura abaixo: </hidden>
<hidden Importação Amostras INPA> Dados extraídos do BRAHMS por Mike em duas ocasiões (a última em Outubro de 2013), foram usados para compilar um arquivo com registros de especímenes no INPA do PDBFF, que foi normatizado em vários aspectos, extraindo das informações das etiquetas o número da reserva e o número da árvore, identificadores únicos para os dados no PDBFF. Finalizando em 20 de Outubro de 2013, foram obtidos:

  1. 5616 registros de amostras do herbário
    1. 89 dos quais foram considerados duplicações após a normatização, e foram excluídos.
    2. Dos 5527 registros restantes:
      1. 2200 tinham um número de árvore anotado em alguma coluna:
        1. apenas 2114 tinham também o número de reserva.
        2. 1617 eram de árvores cuja reserva já estava no banco de dados
          1. 14 nao tem o número da árvore no banco de dados Não Importado
          2. 1603 tem o número da árvore no banco de dados
            1. 70 tem a família diferente com o wiki, o que provavelmente indica que a etiqueta contem um numero errado de árvore - Não importado
            2. 262 tem identificação diferente com o wiki, mas é a mesma familia. Esses tem novos nomes para plantas do PDBFF - Amostra Importada sem a nova Identificação, que precisa ser checada!
            3. 1271 tem a mesma identificação, ou no INPA está faltando identificação - Amostra Importada!
        3. 603 eram de árvores que não estavam no banco de dados:
          1. Os 76 sem número de reserva são coletas de (1 amostra de Dick, C., 1 de Silva, A.P. da, 1 de Silva, C.F. da, 2 de Kukle, P. e 71 de Setz, E.Z.P..
          2. 527 são árvores das reservas 1210 (2), 1501 (439) e TEAM (86).
      2. 3307 não tinham número de árvore anotado em nenhum lugar. Dessas coletas várias são ervas, lianas, etc, mas 1787 são árvores e 1008 tem DAP >= 10 cm, portanto estas últimas podem ser também de árvores das parcelas do PDBFF - a maioria desses registros são de fato do km 41.

ARQUIVOS

</hidden>