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Reunião 13

PI, 05 de maio de 2016

Pautas

O que fiz

  • (Corrigi exercícios e propostas de função do R)
  • Modifiquei código de simula.neutra.step para gravar o número de mortes cumulativo
  • Modifiquei o código de simula_ouput para olhar pro tempo de 1 (ou mais) gerações
  • Modifiquei o código de simula_output para acrescentar análises por espécies (média das médias, média das variâncias, etc) e também “taxa de mudança” da estratégia (diferença entre estratégias final e inicial / estratégia inicial)
  • Modifiquei simula_input para fixar o dp em todas as simulações (e não colocar no hipercubo)
  • Rodei simulações com maior número de ciclos e maior dp para escolher valores que otimizem em relação ao tempo de processamento mas tb permitam que as simulações atinjam o “equilíbrio” (cheguem a K)
  • Pesquisei pacotes e conversei com o Ari sobre paralelização para reduzir meu tempo de “simulagem”

O que fazer

  • Definir dp e número de ciclos para as próximas simulações
  • Conseguir rodar as simulações paralelizadas
  • Realizar SBMA para saber se o número de simulações foi o suficiente
  • Rodar simulações com 1 espécie para base de comparação
  • Rodar simulações com extremos
  • Rodar simulações com caracter neutro para entender o que acontece em “deriva”
  • Pensar como operacionalizar a diversidade de estratégias

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